Après avoir suivi de nombreux ateliers de théâtre au Lycée Montaigne sous la direction de Christian Gonon, il rentre en 1998 aux Ateliers du Sapajou, dirigés par Annie Noël. Il y suit des cours d'interprétation, de chant, de diction et d'acrobatie sous la direction de Philippe Carbonneaux, Arnaud Meunier, Paul Golub et Valentine Cohen. A la suite de cette formation, il rencontre Stanislas Nordey, dans le cadre de deux stages au Théâtre National de Bretagne en 2000 et 2003.
Il rentre en 2000 dans la compagnie Jean-Louis Martin-Barbaz où il devient l'assistant à la mise en scène d'Hervé Van der Meulen sur un opéra de Jacques Offenbach, et sur Le Triomphe de l'Amour de Marivaux. C'est également au sein de cette structure qu'il joue sous la direction de Patrick Simon dans Le Repas de Valère Novarina, et sous la direction d' Yveline Hamon dans Les Trois sœurs et La Cerisaie de Tchekov. Pour ces deux spectacles il réalise cinq courts-métrages. Il interprète aussi le rôle de Frontin dans Le Petit Maître Corrigé de Marivaux mis en scène par Sabine Gousse au Théâtre de La Tempête à la Cartoucherie. Il joue enfin dans La Cuisine d'Arnold Wesker mis en scène par Jean-Louis Martin- Barbaz au Théâtre Sylvia Monfort.
En 2002, il décide de se consacrer à la mise en scène et fonde la Compagnie Mugiscué avec laquelle il crée Les Quatre Jumelles de Copi au théâtre Essaïon et à Agitakt en 2004. Il dirige aussi des ateliers théâtre en milieu scolaire. Il y sensibilise ses jeunes élèves à l'écriture théâtrale contemporaine. En avril 2005 il monte avec Raphaèle Bouchard, dans le cadre des Cartes Blanches du Conservatoires National d'Art Dramatique, une Visite Inopportune de Copi avec des élèves de cette école.
Toujours en 2005, il monte un festival de théâtre brésilien pour l'année du brésil en France avec la pièce Le Baiser sur l'asphalte, au théâtre Mouffetard, et Teatro em Obras, un cycle de lecture, au théâtre de la cité internationale.
En 2006, il monte Normalement, de Christine Angot. Il s’agit de théâtre en appartement.
En 2007, il part avec l’aide de Culturesfrance pour le Brésil à Curitiba, Rio ,Salvador et Sao Paulo où il monte deux textes de Copi traduits pour la première fois en portugais le Frigo et Loretta Strong.
Il vient de créer au CDN Limoges Le Repas de Valère Novarina.
Thomas Quillardet est Lauréat de la Villa Médicis Hors les murs 2007